WGCNA

Weighted correlation network analysis(WGCNA)，即加权相关性网络分析。是用来揭示多组测序数据之间的相关性，寻找共表达网络，确定性状关联基因的重要工具。

具体而言，WGCNA也可以分为上游分析和下游分析两部分。上游分析的主要目的是使用表达矩阵构建TOM矩阵；下游分析的目的是基于TOM矩阵进行个性化分析。

TOM矩阵：Topological Overlap Matrix 拓扑重叠矩阵

上游分析

不可以直接导入全基因表达矩阵，这对于WGCNA而言太多了。

WGCNA一般要求至少5组样品（15个数据），总基因数<3900。