生成bed.gz

By Hongjiang, Feb 15, 2022

samtools官方文档

将.bed文件压缩为 .bed.gz文件，并使用tabix对其构建索引，生成.tbi文件。

.bed文件需要\t分割（TAB-delimited）。

安装samtools

一般使用conda安装samtools。

conda activate $YOUR_ENV
conda install samtools

命令使用

bgzip your.bed && tabix -p bed your.bed.gz

会生成your.bed.gz和your.bed.gz.tbi两个文件。

上传时json文件指定.bed.gz即可，将.tbi放置于.bed.gz同一目录下便会自动加载。